A segurança no sistema de e-learning torna-se um requisito fundamental. Como os sistemas de e-learning estão a tornar-se cada vez mais populares, a necessidade de compreender a segurança também aumentará. É importante garantir que todas as informações dentro do ambiente de e-learning sejam devidamente protegidas, abordando os requisitos de segurança nos sistemas de e-learning para os três processos principais, que são a criação de conteúdo, (ensino e aprendizagem) e organização. Uma estrutura para a segurança do sistema de e-learning é projetada para capturar os requisitos de segurança, que contêm as definições, a visão do utilizador sobre a operação de aprendizagem e as suposições. O Moodle foi escolhido como um estudo de caso para desenvolver os seus sistemas de segurança, tais como controlo de acesso (funções e permissões), autenticação e (backup e recuperação). A estrutura é proposta para ser implementada na Universidade de Ciência e Tecnologia do Sudão usando o sistema de gestão de aprendizagem - Moodle.